Сведения об урожайности используют для анализа колебаний численности зверей и птиц. Но эти данные входят в содержание следующего раздела «Летописи природы», описывающего животный мир заповедника. Так, к примеру, численность белки находится в прямой зависимости от урожая семян хвойных деревьев. Поэтому, оценив урожай шишек, можно дать предварительный прогноз численности белки не только на территории заповедника, но и в той зоне, где он расположен. В целом этот раздел дает характеристику жизни животных за год. В отличие от ботаников, зоологи круглый год должны проводить наблюдения в поле, так как с наступлением зимы жизнь многих видов животных не только не замирает, а, наоборот, становится как бы активнее и заметнее. Большое внимание зоологи уделяют учетным работам. Ведь заповедник — эталон природы, где животные обитают в естественной среде. На основании этих данных строится система охраны и использования диких животных в целом по региону. Учетные работы проводят в течение всего года по определенным методикам. Так, в конце зимы обязателен учет по следам. Это сложная работа: нужно знать следы животных, длину пути их маршрута за сутки, правильно записать все данные. Примерно в это же время проводят авиаучет копытных. В летне-осенний период учеты следуют один за другим: учет воробьиных, водоплавающих и тетеревиных птиц, оценивают численность рыб, амфибий и рептилий, мелких млекопитающих, беспозвоночных. Кроме того, раздел дополняют экологическими обзорами по отдельным группам и наиболее важным видам животных. В них приводят все сведения, собранные в заповеднике за год: не только численность вида, но и размещение по территории, характеристика питания, размножения.

«Летопись природы» иллюстрируют схемами, рисунками и фотографиями. Для работы в заповеднике нужно иметь хорошую научную подготовку, уметь фотографировать, хорошо ориентироваться, читать карту, делать правильные и своевременные записи и многое другое.

Кроме «Летописи природы», общей для всех заповедников, в каждом из них разрабатывают свою научную программу. Тематика этих исследований специфична, характерна только для этого заповедника, важна только для изучения определенного природного комплекса. В описываемых далее заповедниках приведены сведения о наиболее важных темах научной программы и краткие результаты исследований. Особое внимание уделено редким видам растений и животных, занесенным в Красные книги; в тексте они выделены курсивом.